Simulasi Docking Senyawa Aglikon Kurkuligosida A dan Turunannya pada Protein Tyrosine Phosphatase 1B (PTP1B)

Nursamsiar Nursamsiar, Akbar Awaluddin, Megawati Megawati, Yulita M. Soko, Muhammad Aswad

Abstract


Senyawa aglikon kurkuligosida A memiliki struktur yang mirip dengan senyawa licoagrochalcone yang terbukti memiliki aktivitas penghambatan yang kuat secara in vitro pada Protein Tyrosine Phosphatase 1B (PTP1B), yang dianggap sebagai target terapeutik untuk pengobatan diabetes melitus tipe 2. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui interaksi antara senyawa aglikon kurkuligosida A dan turunannya dengan PTP1B menggunakan metode simulasi docking. Simulasi docking dilakukan dengan menggunakan perangkat lunak AutoDock 4.2. Hasil docking menunjukan semua senyawa yang diuji dapat berinteraksi dengan sisi aktif PTP1B. Interaksi terbaik ditunjukkan oleh senyawa 31 (3,5-dihidroksibensil-3,5-dinitrobenzoate), senyawa 39 (3,5-dihidroksibensil-4-nitrobenzoate) dan senyawa 52 (4-hidroksibensil-4-nitro bensoat) dengan nilai energi bebas ikatan berturut-turut –9,40 kkal/mol ; –9,19 kkal/mol dan –9,03 kkal/mol. Ketiga senyawa tersebut memiliki interaksi dengan sisi aktif PTP1B dengan residu asam amino Ser216 dan Arg221. Semua senyawa turunan aglikon kurkuligosida A yang diuji juga memiliki pola pengikatan yang sama dengan ligan alami pada PTP1B.


Keywords


aglikon kurkuligosida A; PTP1B; diabetes; docking

References


Barford, D., Flint, A. J., and Tonks, N. K., 1994, Crystal structure of human protein tyrosine phosphatase 1B. Science, 263: 1397-1404.

Jiang Ch., Lin-fu L., and Yue-wei G., 2012, Natural Products Possessing Protein Tyrosine Phosphatase 1B (PTP1B) Inhibitory Activity Found in The Last Decades, Acta Pharmacologica Sinica, 33 : 1217-1245.

Johnson M.A., Maggiora G.M., Editors, 1990, Concepts and Applications of Molecular Similarity, Wiley.

Kontoyianni, M., McClellan, Sokol, 2004, Evaluation of Docking Performance: Comparative Data on Docking Algorithm. Journal of Medicinal Chemistry, 47: 558-565.

Merentek, E., 2006, Resistesni Insulin pada Diabetes Melitus Tipe 2, Cermin Dunia Kedokteran, No.150 : 38-41.

Nursamsiar, Ibrahim S, Tjahjono D.H., 2014, Hubungan kuantitatif struktur dan aktifitas senyawa turunan aglikon curculigosida A sebagai antikanker. Jurnal Farmasi Indonesia. Vol.7(2): 128-135.

Nursamsiar, Slamet Ibrahim, Daryono H. Tjahjono, 2014, Absorption, Distribution and Toxicity Prediction of Curculigoside A and its Derivatives, 3rd International Conference on Computation for Science and Technology, 32-35

Olokoba A.B., Olusegun A.O., and Lateefat B.O., 2012, Type 2 Diabetes Mellitus: A Review of Current Trends, Oman Medical Journal, Vol.27 (4): 269-273

Patel A.M.,Anand I.S., and Suva M.A., 2014, Role of Protein Tyrosine Phosphatase-1B Inhibitors in Type 2 Diabetes Mellitus, Journal of PharmaSciTech, Vol.4(1): 1-6

Soelistijo, S.A., Novida, H., Rudijanto, A., Soewondo, P., Suastika, K., Manaf, A., dkk., 2015, Konsensus Pengelolaan dan Pencegahan Diabetes Melitus Tipe 2 di Indonesia, PB Perkeni : Jakarta

Sun Jia, Chao Q., Yajun W., Hui H., Mingrui Z., Hongyang L., et al., 2016, PTP1B, A Potential of Type 2 Diabetes Mellitus, Molecular Biology, Vol.5(4) : 1-6

Valls, J., Richard, T, Larronde F., Leblais, V., Muller B., Delaunay J.C., et al. Two New Benzylbenzoate Glucosides from Curculigo orchoides. Fitoterapia. 2006; 77: 416-419.

Wang X.Y., Katrin B., Anna H., Charlotta L., and John E.B., 2001, Analysis Of In Vitro Interactions Of Protein Tyrosine Phosphatase 1B With Insulin Receptors, Molecular and Cellular Endocrinology, Vol.173(1-2) : 10-120


Full Text: PDF

DOI: 10.30595/pharmacy.v16i2.5734

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

ISSN: 2579-910X