Ekspresi Realtif mRNA LMP2A Virus Epstein Barr Pada Berbagai Stadium Karsinoma Nasofaring di RSUD prof. Dr. Margono Soekarjo
DOI:
https://doi.org/10.30595/hmj.v1i2.2564Abstract
Karsinoma nasofaring (KNF) adalah keganasan yang tersering di kepala dan Leher. Karsinogenesis KNF dipengaruhi oleh banyak faktor seperti faktor lingkungan, genetik, dan infeksi virus. Epstein Barr Virus (EBV) terbukti berperan penting dalam karsinogenesis KNF dan salah satu protein yang berperan penting adalah LMP2A. Penelitan ini mengidentifikasi hubungan antara stadium klinis KNF, klasifikasi TNM, dan ekspresi relatif mRNA LMP2A EBV. Biopsi formalin-fixed parafin-embedded (FFPE) dari jaringan tumor primer terkumpul dari 24 pasien KNF. Sampel diproses menggunakan qRT-PCR. Data di analisa dengan metode 2-ΔCt dan dianalisis secara statistik. Seluruh sampel mengekspresikan LMP2A. Berdasarkan analisis statistik tidak ditemukan hubungan stadium tumor dan klasifikasi TNM dengan ekspresi relatif mRNA LMP2A. Namun demikian terdapat tren penurunan Ct dengan peningkatan stadium klinis KNF.References
Wildeman MA, Fles R, Herdini C, Indrasari RS, Vincent AD, Tjokronagoro M, Stoker S, Kurnianda J, Karakullukcu B, Taroeno-Hariadi KW, Hamming-Vrieze O, Middeldorp JM, Hariwiyanto B, Haryana SM, Tan IB. 2013. Primary Treatment Results of Nasopharyngeal Carcinoma (NPC) in Yogyakarta, Indonesia. Plos One Vol 8 issue 5.
Adham M, Kurniawan AN, Muhtadi AI, Roezin A, Hermani B, Gondhowiardjo S, Tan IB, and Middeldorp JM. 2012. Nasopharyngeal Carcinoma in Indonesia: Epidemiology, Incidence, Signs, and Symptoms at Presentation. Chin J Cancer; 31(4): 185–196.
Susworo R. 2004. Kanker nasofaring : epidemiologi dan pengobatan mutahkhir. Cermin Dunia Kedokteran. 2004; 144: 16-9.
Brennan. 2006. Nasopharyngeal carcinoma. Orphanet J Rare Dis.; Vol. 1: 23.
Scholle F, Bendt KM, dan Raab-Traub N. 2000. Epstein-Barr Virus LMP2A Transforms Epithelial Cells, Menginhibisi Cell Differentiation, and Activates Akt. J. Virol. 74 (22): 10681-10689.
Fles R, Wilderman MA, Sulistiono B, Haryana SM, Tan IB. Knowledge of general practioners about nasopharyngeal cancer at Puskesmas in Yogyakarta, Indonesia. BMC Medical Education 2010; 10 (81).
Middeldorp JM, Brink AATP, van den Brule AJC, Meijer CJLM. Pathogenic roles for Epstein-Barr virus (EBV) gene products in EBV-associated proliferative disorders. Crit Rev Oncol Hematol 2003; 45 : 1-36.Scholle F, Bendt KM, dan Raab-Traub N. Epstein-Barr Virus LMP2A Transforms Epithelial Cells, Inhibits Cell Differentiation, and Activates Akt. J. Virol. 74 (22): 10681-10689.
Lin JH, et al. 2015. Epstein-Barr virus LMP2A suppresses MHC class II expression by regulating the B-cell transcription factors E47 and PU.1. Blood vol 125, issue 14: 2228-2238.
Damania B. 2004. Oncogenic ɣ-herpesviruses: Comparison of Viral Proteins Involved in Tumorigenesis. Nature Reviews Microbiology, 2: 656-668.
Morris MA, Dawson CW, dan Young LS. 2009. Role of the Epstein–Barr virusencoded latent membrane protein-1, LMP1, in the pathogenesis of nasopharyngeal carcinoma. Future Oncology 5(6):811-25
Steven SJC, Verkuijlen SAWM, Hariwiyanto B, Harijadi, Paramita DK, Fachiroh J, Marlinda Adham, Tan IB, Haryana SM, Middeldorp JM. Noninvasive diganosis of nasopharyngeal carcinoma : nasopharyngeal brushing reveal high Epstein-Barr virus (EBV) DNA load and carcinoma-specific viral BARF1 mRNA. Int J Cancer. 2006; 119: 608-614.
Cancer American Joint Committee on (2010). Pharynx (Including Base of Tounge, Soft Palate, and Uvula)', in Stephen Edge, et al. (eds.), AJCC Cancer Staging Manual (7 edn.; New York: Springer-Verlag), 33-45.
Livak KJ dan Schmittgen TD. 2001. Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2(-Delta Delta C(T)) Method. Methods.;25(4):402-8.
Budiman F, Zoraya A, dan Nurhalim M. 2015. The Existence of mRNAs and miRNAs Expressions for Maintaining Cell Survival Networks Associated with the Human Transparent and Cataractous Lens. J. Ocular Biol. 3(1):8.
Shahib MN, Budiman, dan Feranty ZA. 2015. Studies on Gene Expressions at the RNA Level Associated with the Senile Lens Changes in Human Lens Cataract. Donnish J. Med. Med. Sci. 2(3):011-8.
Yussy AD, Chippy A and Shahib NM. 2015. The Role of Myeloid Derived Suppressor Cells and CXCR4 Genes Expression for Nasopharyngeal Carcinoma Progression. J. Sci. Res. Stud. 2(8): 195-201.
Bell AI, Groves K, Kelly GL, et al. 2006. Analysis of Epstein–Barr Virus Latent Gene Expression in Endemic Burkitt’s Lymphoma and Nasopharyngeal Carcinoma Tumour Cells by Using Quantitative Real-Time PCR Assays. Journal of General Virology ; 87:2885–2890.
Julie A. Fotheringham dan Raab-Traub N. Epstein-Barr Virus Latent Membrane Protein 2 Effects on Epithelial Acinus Development Reveal Distinct Requirements for the PY and YEEA motifs. J. Virol. December 2013 vol. 87 no. 24 13803-13815.
Lin Z, Wan X, Jiang R, et al. 2014. Epstein-Barr Virus-Encoded Latent Membrane Protein 2A Promotes the Epithelial-Mesenchymal Transition in Nasopharyngeal Carcinoma via Metastatic Tumor Antigen 1 and Mechanistic Target of Rapamycin Signaling Induction. J Virol. ; 88(20): 11872- 11885.
Kong QL, Hu LJ, Cao JY, Huang YJ, Xu LH, Liang Y, Xiong D, Guan S, Guo BH, Mai HQ, Chen QY, Zhang X, Li MZ, Shao JY, Qian CN, Xia YF, Song LB, Zeng YX, Zeng MS. Epstein-Barr virus-encoded LMP2A induces an epithelial-mesenchymal transition and increases the number of side population stem-like cancer cells in nasopharyngeal carcinoma. PLoS Pathog.; 6(6):e1000940.
Ma SD, Tsai MH, Romero-Masters JC, Ranheim EA, Huebner SM, Bristol JA, Delecluse HJ, Kenney SC. Latent Membrane Protein 1 (LMP1) and LMP2A Collaborate To Promote Epstein-Barr Virus-Induced B Cell Lymphomas in a Cord Blood-Humanized Mouse Model but Are Not Essential. J Virol. 2017 Mar 13;91(7). pii: e01928-16. doi: 10.1128/JVI.01928-16.
von Ahlfen S, Missel A, Bendrat K, dan Schlumpberger M. 2007. Determinants of RNA Quality from FFPE Samples. PLoS ONE 2(12): e1261.
Chung JY, Braunschweig T, Williams R, Guerrero N, Hoffmann KM, Kwon M, Song YK, Libutti SK, Hewitt SM. 2008. Factors in tissue handling and processing that impact RNA obtained from formalin-fixed, paraffin-embedded tissue. J Histochem Cytochem. 2008 Nov; 56(11):1033-42.
Kokkat TJ, Patel MS, McGarvey D, LiVolsi VA, dan Baloch ZW. 2013. Archived Formalin-Fixed Paraffin-Embedded (FFPE) Blocks: A Valuable Underexploited Resource for Extraction of DNA, RNA, and Protein. Biopreserv Biobank. 11(2): 101–106.
Bussolati G, Annaratone L, Medico E, D’Armento G, Sapino A. 2011. Formalin fixation at low temperature better preserves nucleic acid integrity. PLoS ONE 6: e21043 doi:10.1371/journal.pone.0021043.
Downloads
Published
How to Cite
Issue
Section
License
For submission of manuscripts to the Herb-Medicine Journal, the authors must certify that:
I have been authorized by my co-author to submit the manuscript to the Herb-Medicine Journal
I hereby declare, on behalf of myself and my co-authors, that:
The submitted manuscript is original work and has not been published in another peer-reviewed journal or is being considered for publication by another journal. Also, the manuscript does not infringe any existing copyright or other third party rights.
The manuscript does not contain material that may violate the law, slander, or SARA, in any way, violates the terms and conditions contained in the agreement
I/we have taken care that the scientific knowledge and all other statements contained in the manuscript are in accordance with authentic facts and formulas and will not, if followed appropriately, harm the user
No liability shall be assumed by Herb-Medicine Journal, its staff or members of the editorial board for any injury and/or damage to persons or property as a matter of product liability, negligence or otherwise, or from the use or operation of any method, product instructions, advertising , or ideas contained in publications by the Herb-Medicine Journal
Authors who publish in the Herb-Medicine Journal certify that all authors have read and agree to the contents of the Cover Letter or the Terms and Conditions. Plagiarism is strictly prohibited, and by submitting a manuscript for publication, the author agrees that the publisher has the legal right to take appropriate action against the author, if plagiarism or false information is found. Once submitted to the Herb-Medicine Journal, authors will not withdraw their manuscript at any stage prior to publication.
The author owns the copyright and grants the journal rights for first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License which allows others to share the work with acknowledgment of the work's authorship and initial publication in this journal.
Authors may enter into separate additional contractual agreements for the non-exclusive distribution of the published journal version of the work (for example, posting it to an institutional repository or publishing it in a book), with acknowledgment of its initial publication in this journal.
Authors are permitted and encouraged to post their work online (for example, in institutional repositories or on their websites) prior to and during the submission process, as this can lead to productive exchanges, as well as earlier and larger citation of published work (See The Effects of Open Access).
Untuk pengiriman naskah ke Herb-Medicine Journal, penulis harus menyatakan bahwa:
- Saya telah diberikan otorisasi oleh rekan penulis saya untuk memasukkan naskah ke Herb-Medicine Journal
- Saya dengan ini menyatakan, atas nama saya dan rekan penulis saya, bahwa:
- Naskah yang dikirimkan adalah karya asli dan belum pernah diterbitkan dalam jurnal peer-review lain atau sedang dipertimbangkan untuk diterbitkan oleh jurnal lain. Serta, naskah tidak melanggar hak cipta yang ada atau hak pihak ketiga lainnya.
- Naskah tidak mengandung materi yang mungkin melanggar hukum, memfitnah, atau SARA, dengan cara apa pun, melanggar syarat dan ketentuan yang tercantum dalam perjanjian
- Saya / kami telah berhati-hati bahwa pengetahuan ilmiah dan semua pernyataan lain yang terkandung dalam naskah sesuai dengan fakta dan formula otentik dan tidak akan, jika diikuti dengan tepat, merugikan pengguna
- Tidak ada tanggung jawab yang ditanggung oleh Herb-Medicine Journal, stafnya atau anggota dewan editorial untuk setiap cedera dan/atau kerusakan pada orang atau properti sebagai masalah pertanggungjawaban produk, kelalaian atau sebaliknya, atau dari penggunaan atau pengoperasian metode, produk apa pun instruksi, iklan, atau ide yang terkandung dalam publikasi oleh Herb-Medicine Journal
Penulis yang menerbitkan dalam Herb-Medicine Journal menyatakan bahwa semua penulis telah membaca dan menyetujui isi Surat Pengantar atau Syarat dan Ketentuan. Plagiarisme dilarang keras, dan dengan menyerahkan naskah untuk publikasi, penulis setuju bahwa penerbit memiliki hak hukum untuk mengambil tindakan yang pantas terhadap penulis, jika ditemukan plagiarisme atau informasi palsu. Setelah diserahkan ke Herb-Medicine Journal, penulis tidak akan menarik naskah mereka pada tahap apa pun sebelum dipublikasikan.
Penulis memiliki hak cipta dan memberikan hak jurnal untuk publikasi pertama dengan karya yang secara simultan dilisensikan di bawah Lisensi Creative Commons Attribution yang memungkinkan orang lain untuk berbagi karya dengan pengakuan kepengarangan karya dan publikasi awal dalam jurnal ini.
Penulis dapat membuat perjanjian kontrak tambahan yang terpisah untuk distribusi non-eksklusif versi jurnal yang diterbitkan dari karya tersebut (misalnya, mempostingnya ke repositori institusional atau menerbitkannya dalam sebuah buku), dengan pengakuan atas publikasi awalnya di jurnal ini.
Penulis diizinkan dan didorong untuk memposting pekerjaan mereka secara online (misalnya, dalam repositori institusional atau di situs web mereka) sebelum dan selama proses pengajuan, karena dapat menyebabkan pertukaran yang produktif, serta kutipan yang lebih awal dan lebih besar dari karya yang diterbitkan (Lihat The Effect of Open Access).
