Isolasi dan Penapisan Bakteri Amilolitik dari Air dan Sedimen Tambak Udang Vaname (Litopenaeus vannamei) di Desa Bunton, Kecamatan Adipala, Kabupaten Cilacap
Keywords:
Vannamei shrimp, amylolytic bacteria, probioticsAbstract
The vaname shrimp pond environment generally contains a lot of organic matter which causes the development of bacterial communities, especially those that are able to degrade organic matter such as carbohydrates. The purpose of this study was to determine the presence and activity index of amylolytic bacteria in water and sediment of vannamei shrimp ponds in Bunton, Adipala, Cilacap. The method used in this study is the observation method with the sampling technique carried out by means of purposive sampling. Amylolytic bacteria can be found in water and sediment of vannamei shrimp ponds with the proportions of 43% and 27%, respectively. There were 14 selected isolates with a high index. The amylolytic bacterial isolates obtained had activity indices ranging from 0.3–3.8 (water) and 0.2–4.3 (sediments). The highest activity index of amylolytic bacteria in water was 3.8, while in sediment it was 4.3. These results indicate that the bacterial isolates have the potential to be further developed into probiotic bacteria.
References
Ali, F. H. M., Samadan, G. M., dan Malan, S. 2020. Peranan Probiotik dalam Budidaya Ikan dan Udang Sistem Bioflok. Zona Akuatik Banggai Journal, 2(2): 17–29.
Ampou, E. E., Triyulianti, I., dan Nugroho, S. C. 2015. Bakteri Asosiasi pada Karang Scleractinia Kaitannya dengan Fenomena La-Nina di Pulau Bunaken. Jurnal Kelautan Nasional, 10(2), 55–63.
Andriani, Y., Hermawati, A., Sari, W., dan Yudha, I. 2019. Tingkat Dekomposisi Bahan Organik Pada Substrat Dasar Tambak Udang Vannamei (Litopenaeus vannamei) di Desa Patas Bagian Timur , Buleleng , Bali. Aquatic Science II, 86, 79–86.
Anggorowati, D. A., Munandar, H., dan Indriana, L. F. 2019. Isolasi Dan Penapisan Bakteri Penghasil Enzim Protease,Selulase,Dan Amilase Dari Sedimen Dan Saluran Pencernaan Teripang Hitam (Holothuria atra). Jurnal Ilmu Dan Teknologi Kelautan Tropis, 11(2), 377–386.
Ari, W. 2012. Isolasi dan Seleksi Bakteri Penghasil Enzim Ekstraseluler (proteolitik, amilolitik, lipolitik dan selulolitik) yang Berasal dari Sedimen Kawasan Mangrove (Isolation and Selection of Extracellular Enzyme Producing Bacteria Originating from Mangrove Sedimen. Ilmu Kelautan: Indonesian Journal of Marine Sciences, 17(3), 164–169.
Arlita, N. R., Radjasa, O. K., dan Santoso, A. 2013. Identifikasi Pigmen Karetonoid Pada Bakteri Simbion Rumput Laut (Kappahycus alvarezii). Diponegoro Journal of Marine Research, 2(3), 58–67.
Arsad, S., Afandy, A., Purwadhi, A. P., Maya V, B., Saputra, D. K., dan Buwono, N. R. 2017. Studi Kegiatan Budidaya Pembesaran Udang Vaname (Litopenaeus vannamei) dengan Penerapan Sistem Pemeliharaan Berbeda Jurnal Ilmiah Perikanan Dan Kelautan, 9(1), 1.
Avnimelech, Y., dan Ritvo, G. 2003. Shrimp and fish pond soils: Processes and management. Aquaculture, 220(1–4), 549–567.
Ayuningrum, D., Sabdaningsih, A., dan Eko Jati, O. 2021. Screening of actinobacteria-producing amylolytic enzyme in sediment from litopenaeus vannamei (Boone, 1931) ponds in Rembang district, Central Java, Indonesia. Biodiversitas, 22(4), 1819–1828.
Balcázar, J. L., Blas, I. de, Ruiz-Zarzuela, I., Cunningham, D., Vendrell, D., dan Múzquiz, J. L. 2006. The role of probiotics in aquaculture. Veterinary Microbiology, 114(3–4), 173–186.
Borght, V. Der, Anne, Goesaert, H., Veraverbeke, W. S., dan Delcour, J. A. 2005. Fractionation of wheat and wheat flour into starch and gluten: Overview of the main processes and the factors involved. Journal of Cereal Science, 41(3), 221–237.
Cahyandi, K., Academy, M., dan Cilacap, N. 2020. Reformasi Sektor Kemaritiman Bagi Pembangunan Ekonomi. Cilacap National Conference On Maritime And Multidisciplinary Study, November 2018, 1–24.
Cappuccino, JG.& Sherman, N. 1987. Microbiology: A Laboratory Manual. The Benjamin/Cummings Publishing Company,Inc.
Cappucino, J.G. dan Sherman, N. 2005. Microbiology A Laboratory Manual. New York: Benjamin Cummings
de Paiva-Maia, E., Alves-Modesto, G., Otavio-Brito, L., Olivera, A., dan Vasconcelos-Gesteira, T. C. 2013. Effect of a commercial probiotic on bacterial and phytoplankton concentration in intensive shrimp farming (Litopenaeus vannamei) recirculation systems. Latin American Journal of Aquatic Research, 41(1), 126–137.
Choirunnisa, H. N., Sari, R. Y., Hastuti, U. S., Witjoro, A. 2017. Identifikasi dan Uji Kemampuan Hidrolisis pada Bakteri Amilolitik dan Proteolitik yang Diisolasi dari Wadi, Makanan Khas Kalimantan Tengah. Jurnal Bionature, 18(2): 99–109.
Devita Fitriani. 2016. Isolasi, Seleksi, dan Identifikasi Bakteri Kitinolitik pada 12 Cairan Tanaman Kantong Semar (Nepenthes Spp.) sebagai Agen Biokontrol. Skripsi. Bogor : Institut Pertanian Bogor.
Dugassa, H., dan Gaetan, D. G. 2018. Biology of White Leg Shrimp, Penaeus vannamei: Review. World Journal of Fish and Marine Sciences, 10(2), 5–17.
Ed-har, A. A., Widyastuti, R., dan Djajakirana, G. 2017. Isolasi Dan Identifikasi Mikroba Tanah Pendegradasi Selulosa Dan Pektin Dari. Buletin Tanah Dan Lahan, 1(1), 58–64.
F.J. Gatesoupe. 1999. The use of probiotics in aquaculture. 180(1), 147–165.
FAO. 2001. Through the Microbial Looking Glass: Premature Labor, Preeclampsia, and Gestational Diabetes: A Scoping Review. RqJournal of Perinatal and Neonatal Nursing, 33(1), 35–51.
Firmansyah, A. 2016. Terapi Probiotik dan Prebiotik pada Penyakit Saluran Cerna Anak. Sari Pediatri, 2(4), 210.
Fuady, M. F., Supardjo, M. N., dan Haeruddin. 2013. Pengaruh Pengelolaan Kualitas Air Terhadap Tingkat Kelulushidupan Dan Laju Pertumbuhan Udang Vaname. Jurnal Maquares, 2, 155–162.
Gunarto, G., Suwoyo, H. S., dan Tampangallo, B. R. 2012. Budidaya Udang Vaname Pola Intensif Dengan Sistem Bioflok Di Tambak. Jurnal Riset Akuakultur, 7(3), 393.
Haliman, R. ., & Adijaya, D. 2006. Udang Vannamei. Penebar Swadaya.
Hardiansyah, M. Y., Musa, Y., dan Jaya, A. M. 2020. Identifikasi Plant Growth Promoting Rhizobacteria pada Rizosfer Bambu Duri dengan Gram KOH 3%. Agrotechnology Research Journal, 4(1), 41–46.
Haryani, K., Samsudin, A. M., & Satriadi, H. 2014. Pembuatan Dekstrin Dari Pati Sorgum Secara Hidrolisis Menggunakan Enzim Α -Amilase.
Hasyimuddin, H., Natsir Djide, M., dan Farid Samawi, M. 2016. Isolasi Bakteri Pendegradasi Minyak Solar Dari Perairan Teluk Pare-Pare. Biogenesis: Jurnal Ilmiah Biologi, 4(1), 41–46.
Istini, I. 2020. Pemanfaatan Plastik Polipropilen Standing Pouch Sebagai Salah Satu Kemasan Sterilisasi Peralatan Laboratorium. Indonesian Journal of Laboratory, 2(3), 41.
Jamilah, It. 2011. Penapisan Bacillus dan Karakterisasi Protease dan Amilase Ekstraseluler Yang Dihasilkan Untuk Degradasi Sisa Pakan Pada Budidaya Udang. Tesis. Bogor:Institut Pertanian Bogor.
Jamilah, IT, Meryandini, A., Rusmana, I., Suwanto, A., dan Rachmania Mubarik, N. 2009. Activity of Proteolytic and Amylolytic Enzymes from Bacillus spp. Isolated from Shrimp Ponds. MIcrobiology Indonesia, 3(2), 67–71.
Jeanua, S., Putra, W., Nitisupardjo, M., dan Widyorini, N. 2014. Analisis Hubungan Bahan Organik Dengan Total Bakteri Pada Tambak Udang Intensif Sistem Semibioflok Di BBPBAP Jepara. Diponegoro Journal of Maquares, 3(3), 121–129.
Komarawidjaja, W. 2003. Pengaruh Aplikasi Konsorsium Mikroba Penitrifikasi Terhadap Konsentrasi Amonia(NH3) Pada Air Tambak. Jurnal Teknik Lingkungan, 4(2), 62-67.
Koswara, S. 2009. Teknologi modifikasi pati. EbookPangan, 1–32. http://tekpan.unimus.ac.id/wp-content/uploads/2013/07/TEKNOLOGI-MODIFIKASI-PATI.pdf
Krishnan, A., Kumar, G., dan Rao, B. 2014. Optimization, production and partial purification of extracellular α-amylase from Bacillus sp. Marini Book-Recent trends and future prospects of Environmental Biotechnology View project CRISPR View project. May 2014.
Kristiawan, D., Widyorini, N., dan Haeruddin. 2014. Hubungan Total Bakteri Dengan Kandungan Bahan Organik Total Di Muara Kali Wiso, Jepara. Diponegoro Journal of Maquares, 3(4), 24–33.
Kunarso, D. H. 2011. Kajian kesuburan ekosistem perairan laut Sulawesi Tenggara berdasarkan aspek bakteriologi. Jurnal Ilmu Dan Teknologi Kelautan Tropis, 3(2), 32–47.
Kurniawati, A. 2015. Isolasi, Seleksi dan Identifikasi Bakteri Penghasil Enzim Ekstraseluler dari Saluran Pencernaan dan Sedimen Tambak Budidaya Udang Vaname (Litopenaeus vannamei) [Universitas Airlangga]. In Universitas Airlangga, Surabaya (Issue September).
Lay, B. W. 1994. Analisa Mikroba Di Laboratorium. Edisi 1. Cetakan 1. Raja Grafindo Persada. Jakarta
Lestari, P. B. 2016. Biodegradasi Limbah Cair Tahu Dari Mikroorganisme Indigen Sebagai Bahan Ajar Mikrobiologi Lingkungan Di Perguruan Tinggi. Jurnal Edukasi Matematika Dan Sains, 2(1), 84.
Mansyur, A., dan Tangko, A. M. 2008. Probiotik: Pemanfaatannya Untuk Pakan Ikan Berkualitas Rendah. Media Akuakultur, 3(2), 145.
Marlida, R., dan Elrifadah, E. 2017. Isolation and Enzymatic Activity Test of Probiotic Candidate From Danau Panggang Swamp Economical Fishes Digestive Tract. Fish Scientiae, 7(2), 133.
MartÃnez Cruz, P., Ibáñez, A. L., Monroy Hermosillo, O. A., dan RamÃrez Saad, H. C. 2012. Use of Probiotics in Aquaculture. ISRN Microbiology, 2012, 1–13.
Murti Pratiwi, N. T., Hariyadi, S., Ayu, I. P., Apriadi, T., Iswantari, A., dan Wulandari, D. Y. 2019. Pengelolaan Kandungan Bahan Organik pada Limbah Cair Laboratorium Proling MSP-IPB dengan Berbagai Kombinasi Agen Bioremediasi. Jurnal Biologi Indonesia, 15(1), 89–95.
Mustafa, M. F., Bunga, M., dan Achmad, M. 2019. Use of Probiotics to Fight Bacterial Populations of Vibrio sp. on Vaname Shrimp Cultivation (Litopenaeus vannamei). Torani : Journal of Fisheries and Marine Science, 2(2), 69–76.
Nababan, E., Putra, I., dan Rusliadi. 2015. Pemeliharaan Udang Vaname (Litopenaeus vannamei) Dengan Persentase Pemberian Pakan Yang Berbeda. Jurnal Ilmiah Perikanan Dan Kelautan, 3(2).
Naim Uddin, M., dan Al-Harbi, A. H. 2005. Quantitative and qualitative bacterial flora of giant freshwater prawn Macrobrachium rosenbergii cultured in earthen ponds in Saudi Arabia. Journal of Aquatic Animal Health, 17(3), 244–250.
Nimrat, S., Suksawat, S., Maleeweach, P., dan Vuthiphandchai, V. 2008. Effect of different shrimp pond bottom soil treatments on the change of physical characteristics and pathogenic bacteria in pond bottom soil. Aquaculture, 285(1–4), 123–129.
Nugroho, A. D., Rifani, A., Winaryo, W., Masduqi, E., Tyas, D. W., Widayanti, R., Masithah, R. A., Romadon, R. D., Sulissetiyo, T., Reiningsih, R., dan Topo, A. H. 2020. Penguatan Strategi Untuk Pengembangan Minapolitan Kabupaten Cilacap. Jurnal Sosial Ekonomi Kelautan Dan Perikanan, 15(2), 145.
Nurbaya, Mansyur, A., dan Kadriah, I. A. K. 2013. Dinamika Kelimpahan Bakteri pada Budidaya Udang Vaname (Litopenaeus vannamei) Intensif dengan Penambahan Molase dan Pergiliran Pakan. Prosiding Forum Inovasi Teknologi Akuakultur, 381–388.
Pangesti, T. P., Wiyono, E. S., Baskoro, M. S., Nurani, T. W., dan Wiryawan, B. 2016. Status Bio-Ekonomi Sumberdaya Udang Di Kabupaten Cilacap. Jurnal Sosial Ekonomi Kelautan Dan Perikanan, 10(2), 149.
Pitrianingsih, C., Suminto, dan Sarjito. 2014. Pengaruh Bakteri Kandidat Probiotik Terhadap Perubahan Kandungan Nutrien C,N,P dan K Media Kultur Lele Dumbo (Clarias gariepinus). Journal of Aquaculture Management and Technology, 3(4), 247–256.
Purnamasari, I., Purnama, D., dan Utami, M. A. F. 2017. Pertumbuhan Udang Vaname (Litopenaeus vannamei) Di Tambak Intensif. Jurnal Enggano, 2(1), 58–67.
Purnawan, A., Capriyanti, Y., Kurniatin, P., dan Rahmani, N. 2015. Optimasi Produksi Enzim Amilase Dari Bakteri Laut Jakarta (Arthrobacter Arilaitensis). Indonesian Journal of Biology, 11(2).
Purnomo, A. H., Reswati, E., dan Hikmah, H. 2004. Pengembangan Industri Perikanan Di Sekitar Kawasan Ekologis Penting: Studi Kasus Cilacap. Jurnal Penelitian Perikanan Indonesia, 10(7), 13.
Rafsen, H. (2018). OPTIMASI PRODUKSI DAN KARAKTERISASI ENZIM α -AMILASE DARI ISOLAT BAKTERI TERMOFIL Bacillus sp RSSII. 71.
Rahayu, A. M. 2020. Hubungan Antara Status Bahan Organik Terhadap Total Kelimpahan Bakteri Pada Perairan Tambak Farm Ferry, Desa Gending, Kabupaten Probolinggo. Skripsi. Banyuwangi : Universitas Airlangga.
Rahmaningsih, S., Wilis, S., & Achmad, M. 2012. Bakteri Patogen di Perairan Pantai dan Kawasan Tambak di kecamatan Jenu Kabupaten Tuban. Ekologia, 12(1), 1–5.
Sabu, E. A., Gonsalves, M. J., Nazareth, D., dan Sreepada, R. A. 2022. Influence of environmental variables on methane related microbial activities in a tropical bio-secured zero-exchange shrimp culture system. Aquaculture Reports, 22(December 2020), 100950.
Safrida, Y. D., Yulvizar, C., dan Devira, C. N. 2012. Isolasi dan karakterisasi bakteri berpotensi probiotik pada ikan kembung (Rastrelliger sp.). Depik Jurnal, 1(3), 200–203.
Sahu, M. K., Swarnakumar, N. S., Sivakumar, K., Thangaradjou, T., dan Kannan, L. 2008. Probiotics in aquaculture: Importance and future perspectives. Indian Journal of Microbiology, 48(3), 299–308.
Santos, E. D. O., dan Martins, M. L. L. 2003. Effect of the medium composition on formation of amylase by Bacillus sp. Brazilian Archives of Biology and Technology, 46(1), 129–134.
Saranraj, D. P., & Naidu, M. A. 2013. Bacterial Amylase: A Review. International Journal of Pharmaceutical & Biological Archives, 4(2), 274–287.
Setiawati, M. 2008. Bakteri Probiotik Dalam Budidaya Udang: Seleksi, Mekanisme Aksi, Karakterisasi, Dan Aplikasinya Sebagai Agen Biokontrol. Jurnal Ilmu Pertanian Indonesia, 13(2), 80–89.
Shakibazadeh, S., Saad, C. R., Christianus, A., Kamarudin, M. S., Sijam, K., Shamsudin, M. N., dan Neela, V. K. 2009. Bacteria flora associated with different body parts of hatchery reared juvenile Penaeus monodon, tanks water and sediment. Annals of Microbiology, 59(3), 425–430.
Silaban, S., dan Simamora, P. 2018. Isolasi dan Karakterisasi Bakteri Penghasil Amilase dari Sampel Air Tawar Danau Toba. EduChemia (Jurnal Kimia Dan Pendidikan), 3(2), 222.
Sinatryani, D. 2014. Kelimpahan Bakteri Selulolitik di Muara Sungai Gunung Anyar Surabaya dan Bancaran Bangkalan. Skripsi. Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan. Universitas Airlangga, Surabaya. 61 hal.
Suciati, P., Tjahjaningsih, W., Dewi Masithah, E., dan Pramono, H. 2019. Aktivitas Enzimatis Isolat Bakteri Asam Laktat dari Saluran Pencernaan Kepiting Bakau (Scylla spp.) Sebagai Kandidat Probiotik. Jurnal Ilmiah Perikanan Dan Kelautan, 8(2), 94.
Sukenda, Hadi, H. 2006. Pengaruh Pemberian Sukrosa Sebagai Sumber Karbon Dan Probiotik Terhadap Dinamika Populasi Bakteri dan Kualitas Air Media Budidaya Udang Vaname, (Litopenaeus vannamei). Akuakultur Indonesia, 5(2), 179–190.
Sundari, A. S., Purwani, N. N., dan Kurniati, A. 2019. Isolasi Dan Penentuan Indekshidrolisis Bakteri Amilolitik Dari Tanah Sediment Mangrove Di Wonorejo, Surabaya. Quantum: Jurnal Inovasi Pendidikan Sains, 10(1), 38.
Supono. 2017. Teknologi produksi udang. In Teknologi Produksi Udang. Universitas Lampung. http://repository.lppm.unila.ac.id/27132/2/DOKUMEN Teknologi Produksi Udang.pdf
Susilawati, I. O., Batubara, U. M., dan Riany, H. 2015. Analisis Aktivitas Enzim Amilase yang Berasal Dari Bakteri Tanah di Kawasan Universitas Jambi. Semirata, 4(1), 359–367.
Suwoyo, H. S., Fahrur, M., Makmur, M., dan Syah, R. 2016. Pemanfaatan Limbah Tambak Udang Super-Intensif Sebagai Pupuk Organik Untuk Pertumbuhan Biomassa Kelekap Dan Nener Bandeng. Media Akuakultur, 11(2), 97–110.
Suwoyo, H. S., Undu, M. C., dan Makmur. 2014. Laju Sedimentasi Dan Karakterisasi Sedimen Tambak Super Intensif Udang Vaname (Litopenaeus vannamei). Proceeding, 1992, 343–355.
Tan Gana, N. H., Mendoza, B. C., dan Monsalud, R. G. 2014. Isolation, screening and characterization of yeasts with amyloytic, lipolytic, and proteolytic activities from the surface of Philippine bananas (Musa spp.). Philippine Journal of Science, 143(1), 81–87.
Taslihan, A, Ani W, Retna H, S.M. Astuti. 2004. Pengendalian Penyakit Pada Budidaya Ikan Air Payau, Direktorat Jenderal Perikanan Balai Besar Budidaya Air Payau Jepara.
Umasugi, A., Tumbol, R. A., Kreckhoff, R. L., Manoppo, H., Pangemanan, N. P. L., dan Ginting, E. L. 2018. Penggunaan bakteri probiotik untuk pencegahan infeksi bakteri Streptococcus agalactiae pada ikan Nila, Oreochromis niloticus. E-Journal BUDIDAYA PERAIRAN, 6(2), 39–44.
Verschuere, L., Rombaut, G., Sorgeloos, P., dan Verstraete, W. 2000. Probiotic Bacteria as Biological Control Agents in Aquaculture. Microbiology and Molecular Biology Reviews, 64(4), 655–671.
Wahyudewantoro, G. 2011. Catatan Biologi Udang Putih Litopenaeus vannamei. Fauna Indonesia, Vol 10(2), 28–31.
Widiyanto, T. 2006. Selection of nitrifying and denitrifying bacteria of bioremediation agents in shrimppond. Disertasi. Sekolah Pascasarjana. Institut Pertanian Bogor. (In Indonesian).
Winarni, I. 2016. Peran Mikroba sebagai Biomonitoring Kualitas Perairan Tawar pada Beberapa Situ. Peran MST Dalam Mendukung Urban Lifestyle Yang Berkualitas, 143–176.
WWF Indonesia. 2014. BMP Budidaya Udang Vannamei Tambak Semi Intensif dengan Instalasi Pengolahan Air LImbah (IPAL). In Jurnal Akuakultur Indonesia (Vol. 22).
Yuka, R. A., Setyawan, A., dan Supono, S. 2021. Identifikasi Bakteri Bioremediasi Pendegradasi Total Ammonia Nitrogen (Tan). Jurnal Kelautan: Indonesian Journal of Marine Science and Technology, 14(1), 20–29.
Zainuddin, Z., Aslamyah, S., dan Hadijah, H. 2018. Efek dari perbedaan sumber karbohidrat pakan terhadap kualitas air, komposisi proksimat dan kandungan glikogen juvenil udang vannamei (Litopenaeus vannamei) (Boone, 1931). Jurnal Ilmiah Samudra Akuatika, 2(1), 1–8.
Zhou, S., Xia, Y., Zhu, C., dan Chu, W. 2018. Isolation of marine bacillus sp. With antagonistic and organic-substances-degrading activities and its potential application as a fish probiotic. Marine Drugs, 16(6).
Downloads
Published
Issue
Section
License
Copyright (c) 2025 Siti Khoirun Nisa, Hamdan Syakuri, Mohammad Nurhafid, Dewi Wisudyanti Budi Hastuti, Nuning Vita Hidayati
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Authors who publish with this journal agree to the following terms:
Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.
Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.
Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access).
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
